辨認Omicron病例 專家:目前最佳方法找S基因缺失



Omicron變異株來勢洶洶,上周在非洲南部被科學家偵測到,但數據顯示在此之前就已開始傳播。各國政府和公衛當局嚴陣以待、進行回溯檢測,試圖釐清它已傳播多遠,現已有二十多個國家通報Omicron病例,且仍須數周的研究以確定它傳染力、致命性是否更高,或是否具疫苗逃脫特性。專家表示,Omicron的S基因缺失變異特性是眼下辨認相關個案的最佳方法。


在偵測到Omicron變異株幾天後,英國和其他主要經濟體禁止往返非洲南部數國的航班,全球金融市場聞訊陷入震盪,並激起各界對經濟損失的擔憂。以色列發現第一個Omicron變異株個案後即宣布對外國人關閉邊界,並將再購買1000萬個能測得Omicron的PCR檢測組。蘇格蘭、新加坡竭力在近期確診者中尋找可能漏網的Omicron蹤跡;歐盟現已在10國發現42個新變異株案例,衛生當局敦促成員國加強檢測力道。


路透報導,絕大多數PCR檢測無法區分Omicron和目前的主流病毒株Delta。欲區分兩者,PCR檢測須能辨識出Omicron的變異特性,即檢測不到S基因靶標(S-gene target failure, SGTF),但這也不是萬全之計,因為最先發現於英國的Alpha變異株也存有這樣的特性。


不過,有鑑於Alpha變異株不再廣泛傳播,有S基因缺失的樣本可能即是染上Omicron變異株,將能示警實驗室進行基因組定序以確認結果。若當地PCR測試無法辨識Omicron變異特性,隨機選擇的PCR拭子樣本則須經過基因組定序,這時程可能需耗費一周。


世界衛生組織(WHO)表示,許多檢測組能夠檢測出是否染上了包含Omicron在內的任何一種變異株;然而,世衛迄今為止僅推薦美國「賽默飛世爾」(Thermo Fisher)製作的TaqPath檢測組。


目前尚不清楚各國是否會採買更多檢測組。新加坡醫藥服務總監麥錫威(Kenneth Mak)告訴路透社,星國正在考慮購買更多,但尚未做出決定。賽默飛世爾則表示,在他們追蹤Omicron變異株傳播之際,也準備好增加產量以因應非洲國家和其他地區的需求。


分析樣本的病毒學家范拉斯特(Marc Van Rast)表示,比利時過去一個月的其中15萬個檢測陽性樣本中,有47個檢測不到S基因靶標並帶有高病毒量,但在這之中,僅有一例是Omicron。


蘇格蘭當局則回溯到11月1日的樣本,並發現9例Omicron確診,且皆與同一個活動有關。他們也發現,11月16日左右,檢測不到S基因靶標這一特性又出現在測試樣本當中,這比在南非和波扎那(Botswana)發現Omicron變異株早了一周。


蘇格蘭醫療長史密斯(Gregor Smith)日前表示:「這(檢測不到S基因靶標)是特定變異株的其中一個特異之處,我們可以善加利用。」這意味政府可以開始估計Omicron變異株的流行程度,找到可能須再次檢測的民眾,以及哪些樣本要列在進行基因組定序的優先順位。「此時此刻,這是我們能夠辨認出(Omicron)案例的最佳方法。」

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